Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN18Q99952 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN18Q99952 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms