Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PITX2Q99697 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PITX2Q99697 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms