Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCL13Q99616 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCL13Q99616 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms