Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LGMNQ99538 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LGMNQ99538 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms