Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIGSQ96S52 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIGSQ96S52 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms