Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNAQ96QF7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GCNAQ96QF7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GCNAQ96QF7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms