Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX8

SLITRK1, SLIT and NTRK-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLITRK1Q96PX8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLITRK1Q96PX8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLITRK1Q96PX8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms