Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF396Q96N95 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF396Q96N95 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF396Q96N95 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms