Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM47Q96LD4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM47Q96LD4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms