Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
LINC00208Q96KT6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
LINC00208Q96KT6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms