Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHACTR3Q96KR7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHACTR3Q96KR7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms