Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TNIP3Q96KP6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNIP3Q96KP6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms