Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRIQ1Q96JM4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRIQ1Q96JM4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRIQ1Q96JM4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms