Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VCPIP1Q96JH7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCPIP1Q96JH7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms