Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCED1BQ96HM7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCED1BQ96HM7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCED1BQ96HM7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCED1BQ96HM7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCED1BQ96HM7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCED1BQ96HM7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCED1BQ96HM7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCED1BQ96HM7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCED1BQ96HM7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCED1BQ96HM7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCED1BQ96HM7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms