Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGF29Q96ES7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGF29Q96ES7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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