Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC10A4Q96EP9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC10A4Q96EP9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms