Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RMDN1Q96DB5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RMDN1Q96DB5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms