Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NKD2Q969F2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKD2Q969F2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms