Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD2Q92925 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMARCD2Q92925 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms