Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RABGGTAQ92696 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
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RABGGTAQ92696 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RABGGTAQ92696 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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