Protein–RNA interactions for Protein: Q92541

RTF1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTF1Q92541 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTF1Q92541 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RTF1Q92541 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms