Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FOXD4L4Q8WXT5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms