Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDAC7Q8WUI4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDAC7Q8WUI4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms