Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC12Q8WUD4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC12Q8WUD4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms