Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FAT3Q8TDW7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FAT3Q8TDW7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FAT3Q8TDW7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FAT3Q8TDW7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAT3Q8TDW7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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