Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KLHDC4Q8TBB5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms