Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP35Q8NFH5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP35Q8NFH5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms