Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACBD4Q8NC06 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms