Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPC24Q8NBT2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPC24Q8NBT2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms