Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COLGALT1Q8NBJ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COLGALT1Q8NBJ5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms