Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG10Q8N0Z9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG10Q8N0Z9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG10Q8N0Z9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG10Q8N0Z9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG10Q8N0Z9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG10Q8N0Z9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG10Q8N0Z9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG10Q8N0Z9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG10Q8N0Z9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG10Q8N0Z9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VSIG10Q8N0Z9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
VSIG10Q8N0Z9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
VSIG10Q8N0Z9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms