Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PASD1Q8IV76 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PASD1Q8IV76 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms