Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALYREFQ86V81 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALYREFQ86V81 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms