Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMS2Q7Z4I7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMS2Q7Z4I7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms