Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APTXQ7Z2E3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APTXQ7Z2E3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms