Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
STRCQ7RTU9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
STRCQ7RTU9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
STRCQ7RTU9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms