Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP0

NIPA1, Magnesium transporter NIPA1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA1Q7RTP0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NIPA1Q7RTP0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NIPA1Q7RTP0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms