Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNG9

KRBA2, KRAB-A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA2Q6ZNG9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRBA2Q6ZNG9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRBA2Q6ZNG9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA2Q6ZNG9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA2Q6ZNG9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA2Q6ZNG9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA2Q6ZNG9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA2Q6ZNG9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA2Q6ZNG9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRBA2Q6ZNG9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRBA2Q6ZNG9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRBA2Q6ZNG9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRBA2Q6ZNG9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms