Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NPNTQ6UXI9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NPNTQ6UXI9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms