Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SUSD1Q6UWL2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SUSD1Q6UWL2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms