Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT2Q6UVM3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT2Q6UVM3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms