Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL35Q6PF15 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL35Q6PF15 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms