Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKN3Q6P5Z2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms