Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF544Q6NX49 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF544Q6NX49 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms