Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP1Q6NVU6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP1Q6NVU6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms