Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HMBOX1Q6NT76 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HMBOX1Q6NT76 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms