Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.043e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.042e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 SCFD2-202ENST00000401642 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.062e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 OGDH-202ENST00000419661 789 ntTSL 58.31□□□□□ -1.082e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.083e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.13e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.132e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.162e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.182e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-208ENST00000460166 552 ntTSL 47.65□□□□□ -1.193e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-209ENST00000460591 898 ntTSL 37.65□□□□□ -1.193e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 OGDH-201ENST00000222673 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.222e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-212ENST00000464596 989 ntTSL 57.37□□□□□ -1.233e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.252e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 OGDH-207ENST00000449767 3479 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.252e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZHX1-206ENST00000522655 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.252e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.312e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 26.85□□□□□ -1.313e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.352e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-216ENST00000478535 1451 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.393e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.42e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.423e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.423e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.432e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.452e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZNF587-202ENST00000419854 5731 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.462e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.473e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZNF587-201ENST00000339656 6882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.492e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TAOK3-203ENST00000535570 597 ntTSL 45.38□□□□□ -1.552e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TMEM245-205ENST00000491854 2435 ntTSL 25.34□□□□□ -1.552e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TAOK3-215ENST00000541878 578 ntTSL 45.06□□□□□ -1.62e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TAOK3-218ENST00000542902 613 ntTSL 35.06□□□□□ -1.62e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.782e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.893e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TAOK3-214ENST00000541786 590 ntTSL 43.18□□□□□ -1.92e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.92e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.993e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 ZHX1-204ENST00000517516 780 ntTSL 32.37□□□□□ -2.032e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.043e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.043e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.053e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.083e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.083e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.133e-6■■□□□ 14
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NIPBLQ6KC79 ZNF644-205ENST00000467231 851 ntTSL 31.1□□□□□ -2.232e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 TAOK3-213ENST00000541186 881 ntTSL 50.48□□□□□ -2.332e-6■■□□□ 14
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NIPBLQ6KC79 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 57.44□□□□□ -1.222e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.262e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.272e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.362e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.412e-6■■□□□ 14
NIPBLQ6KC79 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.432e-6■■□□□ 14
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NIPBLQ6KC79 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.111e-7■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-7■■□□□ 13.9
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NIPBLQ6KC79 ACTG1-207ENST00000574671 1678 ntTSL 1 (best)8.97□□□□□ -0.971e-7■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 215.05■□□□□ -04e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)8.19□□□□□ -1.13e-8■■□□□ 13.9
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NIPBLQ6KC79 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.381e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-223ENST00000498173 1589 ntTSL 217.19■□□□□ 0.341e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 GARS-203ENST00000454308 814 ntTSL 517.06■□□□□ 0.324e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 SLX1A-206ENST00000565081 1558 ntTSL 217.03■□□□□ 0.324e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.274e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-230ENST00000526332 579 ntTSL 415.89■□□□□ 0.131e-8■■□□□ 13.9
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NIPBLQ6KC79 BRD2-209ENST00000469132 1628 ntTSL 215.75■□□□□ 0.114e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.061e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-235ENST00000527719 750 ntTSL 515.26■□□□□ 0.031e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 515.19■□□□□ 0.024e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-206ENST00000430786 849 ntTSL 515.13■□□□□ 0.011e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 515.05■□□□□ 04e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-207ENST00000434694 1056 ntTSL 515.03■□□□□ -01e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.9□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 CCNY-207ENST00000490012 793 ntTSL 314.69□□□□□ -0.064e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.067e-7■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-218ENST00000488042 1134 ntTSL 214.62□□□□□ -0.071e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-232ENST00000526904 551 ntTSL 414.45□□□□□ -0.11e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 GARS-206ENST00000478124 1877 ntTSL 514.45□□□□□ -0.14e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.11e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 314.19□□□□□ -0.144e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-237ENST00000530031 800 ntTSL 514.1□□□□□ -0.151e-8■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.184e-6■■□□□ 13.9
NIPBLQ6KC79 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.181e-8■■□□□ 13.9
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