Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RCSD1Q6JBY9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCSD1Q6JBY9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RCSD1Q6JBY9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms