Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCAPH2Q6IBW4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCAPH2Q6IBW4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms